我们已经谈到了土壤微生物区系的显着代谢多样性和能力。这种能力越来越多地被人类利用和充分利用。从我们对土壤微生物代谢的理解中，一个最有益的衍生是开发了对被陆地和海洋上的危险废物或溢出的石油产品污染的土壤进行生物修复的方法。 生物修复可以定义为控制使用微生物来破坏化学污染物。已经开发了大量的工艺来处理各种废物和清理溢出的有机材料。所有这些过程的核心是一个前提，即细菌或真菌的代谢活动可用于降解许多商业有机化学品（溶剂、杀虫剂、碳氢化合物燃料等）。

通常采用两种形式的生物修复中的任何一种。在生物刺激中，材料已经溢出或以其他方式引入的环境有利于微生物的快速发展。通常，该过程涉及添加足够的氮和磷肥，以克服营养对微生物生长的限制，并提供一些增加系统通气的机制。这些做法鼓励本地微生物种群的发展，这些微生物种群通常包含能够降解感兴趣的化合物的微生物。在生物强化实践中，添加外部微生物群以加速降解过程。已经为此目的开发了许多微生物。然而，这些微生物产品的有用性的完整衡量标准尚不清楚。据报道，一些孕育剂增强了修复过程，而其他孕育剂对该过程几乎没有影响或没有影响。很可能会在适当的时候开发出有用的微生物产品或工艺，用于清理石油或其他化学泄漏物。可以肯定的是，成功的生物修复将需要详细了解在给定环境中使某些微生物比其他微生物更具竞争力的因素。

1989 年 3 月，埃克森瓦尔迪兹号油轮在美国阿拉斯加州威廉王子湾撞上礁石，在 5 小时内向海峡释放了超过 4000 万升原油。海峡和阿拉斯加湾超过 1500 公里（932 英里）的海岸线受到原油不同程度的污染。埃克森瓦尔迪兹石油泄漏事件是一个历史性事件，因为泄漏的规模、待处理区域的广阔和孤立，以及最终涉及的人员和车辆数量众多。生物修复的成功，特别是在像阿拉斯加这样寒冷的气候条件下，促使美国的监管机构更加重视生物修复，而不是以前的物理或化学“埋葬”（储存在水泥墓中）策略。

由于石油本身碳含量高，氮和磷含量低，因此选择了一部分海岸线进行生物刺激。在评估了几种潜在的候选肥料后，选择了微乳液 Inipol EAP22 ^™（以下简称 Inipol）。Inipol（一种“亲油”肥料）是一种稳定的油包水配方，其 NPK 比率为 7.3:0.8:0。氮源为尿素，磷源为三月桂醇聚醚(4)-磷酸盐。在室温下，Inipol 具有蜂蜜的稠度和外观，必须将其加热到 90℃才能喷洒在土壤上。^{Inipol 以 306 ml m -2}的速率作为薄涂层涂在海岸上（每平方码 0.27 夸脱）。当微乳液与风化原油混合时，原油使 Inipol 不稳定，释放出其尿素-N。此外，Inipol 中的一种表面活性有机材料（油酸）可作为一种易于降解的碳和能源，以增加本地碳氢化合物降解细菌的活性和数量。当油酸耗尽时，碳氢化合物降解细菌的生物量增加支持石油的生物降解增强。视觉观察和化学分析表明，生物刺激有助于修复场地。尽管在没有肥料氮和磷的情况下无疑也会发生被动生物修复，但使用 Inipol 观察到的加速生物降解速度对于成功的生物修复工作至关重要。